Szyfrowanie znaków

cin.getline(char[1000], 1000);

pobiera całą linię bez znaku enter. Więc dlaczego stosujesz dodatkowo ignore?

Oczywiście program się nie przerwie od razu bo masz dalej kod (przed warunkiem końca pętli). Ale gdy dojdzie do tej linii  warunek wyrzuci Cię z pętli.

Być może pomocne będzie _{» Kurs C++ v1.0 ♦} Polecenia continue; break; ^lekcja, o czym ktoś już wspomniał wcześniej :)

Już pisałem że gdy usunę ignore i pozostawię samo cin.getline(tekst,1000); to po pierwszym wykonaniu pętli program nie pyta o podanie ciągu znaków tylko od razu przechodzi do pytania o kierunek szyfrowania całkowicie pomija cin.getline(tekst,1000);